用形态学分析方法考虑的精子细胞功能部位，因此认为没有必要常规的去区分所有头部大小和形态之间可划或尾部缺陷之间的变异如果大多数精子细胞中出现某一种部位的异常，则应对这一普通的缺陷给予注释。需记录的缺陷有：
　　
　　（1）头部形状、大小缺陷：包括大头、小头、锥形头、梨头、无定形头、空泡样头（头部大于20%区域出现不着色的空泡区、）双头或以上缺陷的联合体。
　　
　　（2）颈、中段缺陷：包括缺尾可见到游离或脱落的头部，未附着或弯曲尾尾与头部长轴结呈90度角，肿胀、不规则、弯曲的中段，异常薄的中段无线粒体鞘或以上任何类型缺陷的联合体。
　　
　　（3）尾部异常：包括短尾、多尾、发夹状尾、断尾、宽度不规则或卷尾、或尾部伴有末端微滴，或以上任何类型缺陷的联合体。
　　
　　（4）细胞质微粒：大于正常头部的面积的1/3。细胞质微粒一般位于颈可中段部分，也有未成熟精子微粒沿尾部分而布在不同部位。
　　
　　许多形态学的异常的精子有多种缺陷。当多种缺陷同时存在时，只记录一种，但应优先记录头部缺陷，其次为中段缺陷，最后为尾部缺陷。每种精子缺陷的平均数目称为畸形精子指数，是预测精子在体内、体外功能有意义的指标，因此形态学分析应该是多参数原，应分别记录每种缺陷。
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